Fungal diversity in healthy and cladode-thickened Opuntia ficus-indica under drought and rainfall conditions: A metagenomic approach

Resumen

Opuntia ficus-indica es reconocida por su resiliencia a condiciones ambientales adversas; sin embargo, sigue siendo susceptible a diversas enfermedades causadas por factores bióticos y abióticos. Entre estas, el engrosamiento de cladodios representa una limitación importante, aunque sus agentes causales no han sido identificados definitivamente, se ha sugerido a los fitoplasmas y virus como contribuyentes potenciales; sin embargo, el medio donde se desarrollan las plantas desempeña también un papel importante.

Este estudio tuvo como objetivo caracterizar la estructura, diversidad y relaciones filogenéticas de las comunidades microbianas en diferentes compartimentos de plantas cultivadas de Opuntia ficus-indica, comparando individuos sanos y con cladodios engrosados, mediante análisis metagenómico del gen 16S rRNA durante las temporadas de lluvias y secas en el Estado de México.

Se recolectaron muestras durante las temporadas de lluvias y de estiaje en San Miguel Atlamajac, Temascalapa, Estado de México. Se analizaron cinco compartimentos ecológicos: suelo, rizosfera, endosfera radicular, filosfera y endosfera de cladodios. Se secuenció la región V3-V4 del gen ARNr 16S de procariotas y se realizaron análisis bioinformáticos mediante el pipeline de Mothur.

Los resultados revelaron diferencias en la diversidad bacteriana y la estructura taxonómica entre los compartimentos vegetales, influenciadas tanto por la presencia o ausencia de engrosamiento de cladodios, así como por las condiciones ambientales (temporada lluviosa versus seca).